主债权已过诉讼时效，抵押权不会失效。主债权已过诉讼时效时，债务人可以对债权人提起诉讼提出抗辩权，抵押权人丧失人民法院对抵押权的保护。债权的有效诉讼时间是三年，权利人应当从知道其权利受到损害的那天起及时诉讼维权。

　　一、主债权已过诉讼时效，抵押权是否失效

　　主债权因超诉讼时效丧失的只是胜诉权，并不消灭实体权利，抵押权作为效力更强的物权，因主债权诉讼时效已过而径行消灭，逻辑上是不能成立的，物权法定，物权消灭须有法定理由，主债权超诉讼时效非抵押权消灭法定理由；“受法律保护”与“受法院保护”不同，我国法律规定的是抵押权司法保护期，并非抵押权存续期间，主债权诉讼时效期满后，抵押权人丧失的是抵押权受法院保护权即胜诉权，抵押权本身并未消灭，胜诉权丧失一般等同于权利消灭效果，但二者有区别；作为“一般”之外的特殊情形，亦即超过抵押权行使期限，抵押人自愿配合履行，嗣后再反悔的，法院不再支持，即“自然”状态的抵押权在理论上存在并受法律保护。

　　就诉讼时效而言，其以请求权人怠于行使权利持续至法定期间状态为规制对象，目的在于让罹于时效的请求权人承受不利益，以起到促其及时行使权利之作用，依民法理论通说，其适用范围限于债权请求权。而就抵押权而言，其属支配权，并非请求权范围，更非债权请求权范围，如将抵押权纳入诉讼时效规制范围，无疑有违民法原理。

　　二、诉讼时效要件

　　（一）须有请求权的存在。诉讼时效是对请求权的限制，没有请求权，也就无从适用诉讼时效。

　　（二）须有怠于行使权利的事实。诉讼时效是对权利人的督促，实际上也是对义务人的保护，如果权利人怠于行使权利经过一定的期间，又没有其他事由致使诉讼时效中断或中止，则诉讼时效产生法律效果。

　　（三）怠于行使权利的事实持续存在，致使诉讼时效期间届满。届满有时又称为诉讼时效结束、诉讼时效完成。诉讼时效届满，权利人的胜诉权自动消灭。如果有使诉讼时效中断、中止的事实，诉讼时效还可以延长，即中断时重新计算，中止时，将中止时间段剔除后继续计算。

　　三、主债务已过诉讼时效抵押权怎么办

　　根据《民法典》第四百一十九条　抵押权人应当在主债权诉讼时效期间行使抵押权;未行使的，人民法院不予保护。

　　虽说主债务已过诉讼时效，抵押权人丧失的是抵押权受人民法院保护的权利(即胜诉权)，而抵押权本身并没有消灭，如果抵押人自愿履行担保义务的，抵押权人仍可以行使抵押权。

　　综上所述，主债权已过诉讼时效并不是抵押权消灭的法定理由，权利的消灭必须具备法定条件才归于灭失，所以出现这种情形的，如果对方抗辩，原告很可能丧失胜诉权。