被免除刑事处罚会留案底。已经构成犯罪，就会有案底。免予刑事处罚，只是免除对被告人刑罚而没有免除被告人的刑事责任。犯罪时未年满18周岁，且判刑时间在五年以下，法院会依法对犯罪记录进行封存。

　　1.两者的法律依据不同

　　如上所述，免予刑事处罚所依据的是《刑法》三十七条的规定，而无罪判决所依据的是《刑事诉讼法》第一百六十二条的规定。一个是实体法，一个为程序法。

　　2.两者的适用条件不同

　　从《刑法》第三十七条我们可以知道，免予刑事处罚要符合两个条件：一是犯罪情节轻微，二是不需要判处刑罚。只有当两个条件同时符合时，才能适用免予刑事处罚。

　　3.两者的法律后果不同

　　免予刑事处罚是人民法院认定某种行为构成犯罪，但因犯罪情节轻微，而判决免予刑罚的一种处罚。是人民法院以被告人构成犯罪为前提，以犯罪情节轻微不需要判处刑罚为概括性条件的随法选择。法律规定应当免除刑罚的，必须判决免除刑罚。

　　简言之，免于刑事处罚，是有罪而免罚，仍然构成刑事犯罪。通俗地说就是有犯罪前科。

　　而无罪判决的法律后果是：当嫌疑人被羁押的，应当立即释放。无罪，当然就无需承担刑事责任，不受刑事处罚。

　　法律快车提醒您，若公职人员作出了犯罪行为，但是被免于刑事处罚的，一般是不需要开除其公职的。根据我国《行政机关公务员处分条例》的规定，行政机关公务员依法被判处刑罚的，给予开除处分。

　　《行政机关公务员处分条例》第十七条

　　 违法违纪的行政机关公务员在行政机关对其作出处分决定前，已经依法被判处刑罚、罢免、免职或者已经辞去领导职务，依法应当给予处分的，由行政机关根据其违法违纪事实，给予处分。

　　 行政机关公务员依法被判处刑罚的，给予开除处分。