我国现行内资企业所得税名义税率为33%，但从全国范围平均值看，企业实际负担率为24.53%。两税合一改革后，内资企业的所得税税率将由33%降为25%，下降了八个百分点，下降幅度高达百分之二十四。再加上考虑到计算内资企业所得税时，工资支出据实扣除、企业研发费用加计扣除、提高企业广告费扣除比例等政策，对符合条件的小型微型企业实行20%的优惠税率，税收优惠有增有减，总体保持不变，实际税收负担率将与名义负担率同步变化，即全国内资企业实际负担率将由24.53%下降为20%左右。

由于税改对内资企业减税效应比较明显，利于提高企业赢利率，增加企业投资回报率，增强企业竞争力。但由于各类企业原有税负情况不同：一些原享受减免税优惠企业正效应会小一些，甚至出现增加税收的负效应；而一些原没有享受税收优惠，税负会得到明显下降。享受20%税率的中小企业可能影响更大一些。