中国科学院院部作为一个领导部门，管理工作上要做到“大的方面管住管好，小的方面放开放活”，要面向四化，面向世界，面向未来，又要面向基层，为基层服务，努力提高工作效率和管理水平。院机关干部要克服和防止官僚主义，经常深入下去，调查研究，检查督促，帮助解决问题，支持各所所长行使职权。
院部的主要任务是：
一、贯彻执行中央的路线、方针和政策，遵守国家的法律，制定我院各项工作的方针、政策、规章制度，积极推动管理改革；
二、调查研究世界科技发展新动向和国家经济建设、社会发展对科学技术工作的要求，对我院科研发展战略做出决策，组织编制规划、计划并安排落实；
三、按基金制、合同制的要求，管好对国家四化建设有全局性的、关键的、综合性的以及某些有长远影响的科研项目，有重点地抓好新技术开发和重大成果的推广应用；
四、大力推动院属单位与地方、产业部门、企业和高等院校的横向联系，放手鼓励科技人员投身经济建设；组织国内外重大的学术交流与科技合作；
五、组织经费、物资、基建等工作和生活条件的保证和综合平衡，确定分配方案；
六、决定院属独立机构的设立和调整，决定全院科技队伍建设的重大措施，决定全院各单位主要领导干部的任免和研究员职称的评定，决定重大奖励事项；
七、领导思想政治工作，抓好精神文明建设；
八、做好院属单位重要工作的部署、检查、评议、考核和对有关人员的奖惩，组织好经验交流工作，加强法制、信息、统计、审计工作；
九、组织对全国重大科学技术问题和国民经济建设问题进行咨询。
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