经政府批示在自家的院子里建房的不算违法建筑。农村的土地所有权都属于村集体，未经批准不可以随意在院子里建房。建房需向当地村委会提出申请，经乡镇人民政府土地管理部门批准、下发土地使用权和规划许可证后方可修建。法律依据：《城乡规划法》第四十条在城市、镇规划区内进行建筑物、构筑物、道路、管线和其他工程建设的，建设单位或者个人应当向城市、县人民政府城乡规划主管部门或者省、自治区、直辖市人民政府确定的镇人民政府申请办理建设工程规划许可证。《土地管理法》第六十二条农村村民建住宅，应当符合乡镇土地利用总体规划、村庄规划，不得占用永久基本农田，并尽量使用原有的宅基地和村内空闲地。编制乡镇土地利用总体规划、村庄规划应当统筹并合理安排宅基地用地，改善农村村民居住环境和条件。农村村民住宅用地，由乡镇人民政府审核批准；其中，涉及占用农用地的，依照本法第四十四条的规定办理审批手续。
