兼并合同纠纷需要注意：一是企业合并是企业行为，但需经股东大会决议同意；二是企业控股不发生被控股企业主体资格的消灭，企业合并导致被吸收企业或者合并各方主体资格消灭。法律依据：《中华人民共和国公司法》第一百七十三条公司合并，应当由合并各方签订合并协议，并编制资产负债表及财产清单。公司应当自作出合并决议之日起十日内通知债权人，并于三十日内在报纸上公告。债权人自接到通知书之日起三十日内，未接到通知书的自公告之日起四十五日内，可以要求公司清偿债务或者提供相应的担保。第一百七十四条公司合并时，合并各方的债权、债务，应当由合并后存续的公司或者新设的公司承继。
