检察院二次退查案件后怎么处理

检察院二次退补的后果是补充调查后，认为证据不足的，不符合法定起诉条件的，检察院应当作出不起诉的决定。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》规定，补充侦查人民检察院审查案件，可以要求公安机关提供法院审判所需的证据材料；认为本法规定的非法收集证据的，可以要求其说明收集证据的合法性。
人民检察院审查案件，需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查或者自行侦查。补充侦查的案件，应当在一个月内完成补充侦查。补充侦查以二次为限。补充侦查移送人民检察院后，人民检察院重新计算起诉期限。
人民检察院仍认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。法律依据：《中华人民共和国刑事诉讼法》
第一百七十五条
人民检察院审查案件，可以要求公安机关提供法庭审判所必需的证据材料；认为可能存在本法第五十六条规定的以非法方法收集证据情形的，可以要求其对证据收集的合法性作出说明。
人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。
对于补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕。补充侦查以二次为限。补充侦查完毕移送人民检察院后，人民检察院重新计算审查起诉期限。
对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。
第五十六条
采用刑讯逼供等非法方法收集的犯罪嫌疑人、被告人供述和采用暴力、威胁等非法方法收集的证人证言、被害人陈述，应当予以排除。收集物证、书证不符合法定程序，可能严重影响司法公正的，应当予以补正或者作出合理解释；不能补正或者作出合理解释的，对该证据应当予以排除。
在侦查、审查起诉、审判时发现有应当排除的证据的，应当依法予以排除，不得作为起诉意见、起诉决定和判决的依据。