办理农村房产证改户主的手续是:提交登记申请书、申请人的身份证明、房屋所有权证书、宅基地使用权证明、证明房屋所有权转移发生的材料和其它必要材料到登记部门进行转移登记。并且还需要提交农村集体经济组织同意转移的证明材料。法律依据:《城市房地产管理法》第六十一条房地产转让或者变更时,应当向县级以上地方人民政府房产管理部门申请房产变更登记,并凭变更后的房屋所有权证书向同级人民政府土地管理部门申请土地使用权变更登记,经同级人民政府土地管理部门核实,由同级人民政府更换或者更改土地使用权证书。法律另有规定的,依照有关法律的规定办理。《民法典》第二百一十条不动产登记,由不动产所在地的登记机构办理。国家对不动产实行统一登记制度。统一登记的范围、登记机构和登记办法,由法律、行政法规规定。