公司间发生合同纠纷,可以按下列步骤来走法律程序:1、到法院起诉或者向仲裁机构申请仲裁;2、上述机构决定是否受理;3、决定受理的,再进行调解或者依法作出裁判;4、依法履行生效的裁决;5、若一方拒不履行的,另一方可以申请法院强制执行。法律依据:《中华人民共和国仲裁法》第二条平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷,可以仲裁。《中华人民共和国民事诉讼法》第一百二十三条起诉应当向人民法院递交起诉状,并按照被告人数提出副本。书写起诉状确有困难的,可以口头起诉,由人民法院记入笔录,并告知对方当事人。第一百二十五条当事人起诉到人民法院的民事纠纷,适宜调解的,先行调解,但当事人拒绝调解的除外。