招标代理公司注册流程如下:1、向建设部门申请注册资质;2、去工商所进行查名;3、凭核发的查名核准单、银行询证函、一套章去就近银行办理注册资金进账手续,领取投资人缴款单和对账单,由会计事务所办理验资报告;4、带好身份证前往工商所进行签字;5、办理营业执照;6、办理税务登记证。法律依据:《招标投标法》第十三条招标代理机构是依法设立、从事招标代理业务并提供相关服务的社会中介组织。招标代理机构应当具备下列条件:(一)有从事招标代理业务的营业场所和相应资金;(二)有能够编制招标文件和组织评标的相应专业力量。《招标投标法》第十四条招标代理机构与行政机关和其他国家机关不得存在隶属关系或者其他利益关系。《招标投标法》第十五条招标代理机构应当在招标人委托的范围内办理招标事宜,并遵守本法关于招标人的规定。