疫情期拒绝复工的员工不可以旷工处理。可以与劳动者进行协商,达成采取调整薪酬、轮岗轮休、缩短工时等方式进行工作的意见,若企业停工停产在一个工资支付周期内的,企业应按劳动合同规定的标准支付职工工资。法律依据:《中华人民共和国传染病防治法》第四十一条
在隔离期间,实施隔离措施的人民政府应当对被隔离人员提供生活保障;被隔离人员有工作单位的,所在单位不得停止支付其隔离期间的工作报酬。
《关于妥善处理新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控期间劳动关系问题的通知》二
企业因受疫情影响导致生产经营困难的,可以通过与职工协商一致采取调整薪酬、轮岗轮休、缩短工时等方式稳定工作岗位,尽量不裁员或者少裁员。符合条件的企业,可按规定享受稳岗补贴。企业停工停产在一个工资支付周期内的,企业应按劳动合同规定的标准支付职工工资。超过一个工资支付周期的,若职工提供了正常劳动,企业支付给职工的工资不得低于当地最低工资标准。职工没有提供正常劳动的,企业应当发放生活费,生活费标准按各省、自治区、直辖市规定的办法执行。