变更房屋租赁合同的程序如下:1、出租人与承租人协商变更事项;2、按照约定,签订房屋租赁合同;3、出租人携带身份证明、变更后的房屋租赁合同到房屋所在地直辖市、市、县人民政府建设(房地产)主管部门办理房屋租赁变更登记备案。根据2021年生效的《民法典》第五百四十三条的规定,当事人协商一致,可以变更合同。《商品房屋租赁管理办法》第十四条第一款规定,房屋租赁合同订立后三十日内,房屋租赁当事人应当到租赁房屋所在地直辖市、市、县人民政府建设主管部门办理房屋租赁登记备案。法律依据:《民法典》第五百四十三条当事人协商一致,可以变更合同。《商品房屋租赁管理办法》第十四条第一款房屋租赁合同订立后三十日内,房屋租赁当事人应当到租赁房屋所在地直辖市、市、县人民政府建设(房地产)主管部门办理房屋租赁登记备案。