一般情况下，三方协议是毕业生、学校和用人单位共同签订的，用于约定毕业生毕业后到用人单位就业的事宜。如果毕业论文没有通过，导致无法获得毕业证和学位证，可能会影响到你按照三方协议到用人单位就业。在这种情况下，你需要与用人单位协商，看看是否可以免除违约金。如果用人单位同意，那么你可以不支付违约金。但是，如果用人单位不同意，那么你可能需要支付违约金。需要注意的是，每个用人单位对于这种情况的处理可能都不同，你需要根据实际情况与用人单位协商，并尽可能提供相关证明，以便用人单位同意免除违约金。此外，如果你因为毕业论文没有通过而无法获得毕业证和学位证，你需要尽快与学校联系，看看是否可以补救，或者是否可以获得其他证书，以便能够就业。
